Prieš laikant ar pristatant, žuvų miltai turi būti supakuoti. Pakavimo maišelyje paprastai naudojamas austi polietileno maišelis. Pakavimo darbus galima suskirstyti į dviejų rūšių mechanines pakuotes ir rankines pakuotes. Rankinio pakavimo įranga yra labai paprasta, reikia tik svarstyklių, nešiojamosios siuvimo mašinos ir kitų paprastų įrankių. Pakuočių automatizavimo laipsnis priklauso nuo gamyklos gamybos ir perdirbimo pajėgumų dydžio. Mechaninę pakuotę su aukštesniu automatizavimo laipsniu priėmė vis daugiau gamintojų. Sistema tinka surinkimo linijos veikimui, kompaktiškai struktūrai, mažesniam užimtumo plotui, tiksliam svėrimui ir matavimui, o tai gali pagerinti darbo efektyvumą, sumažinti darbą ir sutaupyti gamybos sąnaudas. Supakuotus žuvies miltus po sandarinimo galima nusiųsti tiesiai į sandėlį saugojimui.
Automatinę pakavimo sistemą daugiausia sudaro pakavimo sraigtinis konvejeris, automatinė kiekybinė pakavimo skalė, juostinis konvejeris su svėrimo įtaisu ir ekranu bei siuvimo mašina. Jos svėrimo ir pakavimo procesas yra naudoti svėrimo ekrano valdiklio programos valdymo funkciją, kad būtų galima realizuoti pakavimo sraigtinio konvejerio padavimo valdymą, kad būtų pasiektas tikslus matavimo efektas. Baigus svėrimą, maišeliai per juostinį konvejerį perkeliami į maišų siuvimo mašiną, kad būtų užbaigti sandarinimo darbai. Gatavus žuvų miltus maišuose po sandarinimo galima tiesiogiai nusiųsti į sandėlį saugoti. Ši automatinė pakavimo sistema taip pat gali patenkinti kitų miltelių pavidalo medžiagų poreikius, kuri yra labai populiari tiek vidaus, tiek tarptautinėse rinkose.